More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0753 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  100 
 
 		 572 aa  1150    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  46.95 
 
 		 537 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  41.52 
 
 		 563 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  42.69 
 
 		 562 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  42.58 
 
 		 543 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  43.23 
 
 		 559 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  43.23 
 
 		 559 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  43.35 
 
 		 559 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  42.51 
 
 		 561 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  40.9 
 
 		 567 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  42.51 
 
 		 561 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  42.51 
 
 		 561 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  43.35 
 
 		 559 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  40.18 
 
 		 609 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  42.69 
 
 		 550 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  40.77 
 
 		 556 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  42.39 
 
 		 560 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  43.27 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  39.36 
 
 		 556 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  41.39 
 
 		 549 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  39.77 
 
 		 530 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  40.39 
 
 		 561 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  39.89 
 
 		 546 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  42.34 
 
 		 544 aa  360  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  39.27 
 
 		 569 aa  348  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  39.28 
 
 		 559 aa  344  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  42.2 
 
 		 554 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  36.78 
 
 		 585 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  38.2 
 
 		 538 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  39.09 
 
 		 577 aa  317  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  38.99 
 
 		 614 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  27.55 
 
 		 546 aa  178  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  28.03 
 
 		 625 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.59 
 
 		 830 aa  170  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  26.08 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  26.08 
 
 		 470 aa  167  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  25.92 
 
 		 470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  28.83 
 
 		 547 aa  160  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  28.67 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  26.54 
 
 		 506 aa  159  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  26.92 
 
 		 569 aa  157  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  28.7 
 
 		 541 aa  155  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  27.25 
 
 		 508 aa  153  8e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  25.93 
 
 		 563 aa  144  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  27.2 
 
 		 581 aa  143  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.67 
 
 		 506 aa  140  7.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  31.69 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3405  type II and III secretion system protein  32.23 
 
 		 594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.94 
 
 		 574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  24.02 
 
 		 463 aa  126  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0500  type II secretion system protein, putative  26.89 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0578  type II and III secretion system protein  23.88 
 
 		 527 aa  114  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  27.44 
 
 		 492 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  27.44 
 
 		 482 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  27.44 
 
 		 482 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  27.44 
 
 		 482 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  27.44 
 
 		 482 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  27.44 
 
 		 482 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 482 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  28.49 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  30.25 
 
 		 783 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  30.03 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  28.57 
 
 		 819 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  30.25 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  33.81 
 
 		 602 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  26.43 
 
 		 751 aa  105  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  31.01 
 
 		 660 aa  103  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  30.95 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  25.92 
 
 		 675 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  28.02 
 
 		 686 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  25.12 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  26.98 
 
 		 660 aa  102  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  28.99 
 
 		 641 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  26.56 
 
 		 803 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  30.85 
 
 		 745 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  28.47 
 
 		 783 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  26.16 
 
 		 689 aa  98.2  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  30.17 
 
 		 635 aa  97.8  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  26.21 
 
 		 703 aa  96.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  26.95 
 
 		 807 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  27.83 
 
 		 681 aa  96.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  30.51 
 
 		 630 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  26.92 
 
 		 702 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  26.63 
 
 		 704 aa  94.7  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  28.76 
 
 		 702 aa  94.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  27.71 
 
 		 686 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  26.77 
 
 		 738 aa  94.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  26.92 
 
 		 704 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  27.71 
 
 		 686 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  27.71 
 
 		 686 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  30.38 
 
 		 686 aa  94  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  27.08 
 
 		 787 aa  94  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  27.71 
 
 		 686 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  26.13 
 
 		 805 aa  93.2  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  23.54 
 
 		 915 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  28.21 
 
 		 736 aa  93.2  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  26.84 
 
 		 705 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  26.48 
 
 		 810 aa  92.8  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  24.73 
 
 		 672 aa  93.2  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  24.52 
 
 		 712 aa  92.8  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>