36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2826 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3589  hypothetical protein  62.34 
 
 
165 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793233  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3099  hypothetical protein  54.96 
 
 
200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0223818  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3040  hypothetical protein  54.96 
 
 
200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3056  hypothetical protein  54.96 
 
 
200 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0029  hypothetical protein  45.8 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0564693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1989  hypothetical protein  45.78 
 
 
205 aa  64.3  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  50 
 
 
219 aa  58.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1384  hypothetical protein  38.3 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  32.73 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3808  hypothetical protein  37.78 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176613  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  35.04 
 
 
228 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  41.57 
 
 
184 aa  51.6  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1337  hypothetical protein  31.58 
 
 
266 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  34.34 
 
 
144 aa  51.2  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  35.29 
 
 
249 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4199  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112437  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.11 
 
 
438 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  36.63 
 
 
218 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  36.19 
 
 
137 aa  48.1  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01690  hypothetical protein  29.05 
 
 
323 aa  47.4  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000277676  decreased coverage  0.0000000000000177257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  35.4 
 
 
181 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  32.22 
 
 
236 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  38.04 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  34.62 
 
 
104 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1987  hypothetical protein  45.54 
 
 
193 aa  44.7  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  31.51 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  31.51 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  31.51 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0548  hypothetical protein  38.24 
 
 
521 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0242  hypothetical protein  39.29 
 
 
339 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  31.9 
 
 
178 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0688  hypothetical protein  33.12 
 
 
381 aa  41.2  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2399  hypothetical protein  32.69 
 
 
115 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>