16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0029 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0029  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  265  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0564693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  47.41 
 
 
172 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3589  hypothetical protein  37.7 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793233  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3040  hypothetical protein  36.21 
 
 
200 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3099  hypothetical protein  36.21 
 
 
200 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0223818  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3056  hypothetical protein  35.34 
 
 
200 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2116  hypothetical protein  37.93 
 
 
174 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1989  hypothetical protein  36.14 
 
 
205 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  30.34 
 
 
218 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1337  hypothetical protein  34.34 
 
 
266 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37310  hypothetical protein  36.84 
 
 
210 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.194824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  38.95 
 
 
236 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0242  hypothetical protein  35.29 
 
 
339 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25630  hypothetical protein  34.02 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0280671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  38.57 
 
 
219 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01100  hypothetical protein  33.75 
 
 
189 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>