25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8090 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8090  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  712    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  49.53 
 
 
491 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 
719 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49964  predicted protein  39.44 
 
 
387 aa  57  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3112  hypothetical protein  41.94 
 
 
636 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0225252  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  38.36 
 
 
607 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4835  hypothetical protein  36.78 
 
 
1168 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.391306  decreased coverage  0.000518688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1158  repeat of unknown function XGLTT  34.95 
 
 
324 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.04272  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  34.92 
 
 
3521 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  34.19 
 
 
3472 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2907  hypothetical protein  23.3 
 
 
625 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  34.19 
 
 
3471 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  29.14 
 
 
259 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1197  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  30 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  41.18 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  32.1 
 
 
973 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  26.98 
 
 
3295 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  43.1 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  42 
 
 
218 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  42 
 
 
218 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  42 
 
 
218 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  42 
 
 
218 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  42 
 
 
218 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  42 
 
 
218 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  42 
 
 
218 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>