26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0574 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0562  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0574  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  decreased coverage  0.00309867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0552  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.798791  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0183  hypothetical protein  60.28 
 
 
243 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0722  hypothetical protein  65.81 
 
 
209 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2084  hypothetical protein  38.78 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35360  hypothetical protein  34.23 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3422  hypothetical protein  36.04 
 
 
150 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3650  hypothetical protein  33.01 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3649  hypothetical protein  29.7 
 
 
289 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0478  hypothetical protein  29.13 
 
 
163 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.695853  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0479  hypothetical protein  31.4 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.627606  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0547  hypothetical protein  35.09 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2457  hypothetical protein  22.75 
 
 
243 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26690  hypothetical protein  32.14 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0480  hypothetical protein  26.56 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4716  hypothetical protein  31.37 
 
 
296 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3015  hypothetical protein  23.58 
 
 
179 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.430528  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  55.1 
 
 
323 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4281  hypothetical protein  33.77 
 
 
295 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4422  hypothetical protein  32.14 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  40.59 
 
 
160 aa  45.1  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0897  hypothetical protein  30.56 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0845293  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  29.84 
 
 
455 aa  42  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6995  hypothetical protein  36.89 
 
 
276 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.641964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  50 
 
 
974 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>