17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1061 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1061  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  358  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26690  hypothetical protein  49.43 
 
 
192 aa  158  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2084  hypothetical protein  30.47 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3422  hypothetical protein  24.55 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0480  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3015  hypothetical protein  30.67 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.430528  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0478  hypothetical protein  26.5 
 
 
163 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.695853  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  25.78 
 
 
484 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0183  hypothetical protein  30.36 
 
 
243 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0722  hypothetical protein  28.83 
 
 
209 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0479  hypothetical protein  24.43 
 
 
206 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.627606  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3649  hypothetical protein  30.16 
 
 
289 aa  47.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0552  hypothetical protein  27.03 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.798791  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0574  hypothetical protein  27.03 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  decreased coverage  0.00309867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0562  hypothetical protein  27.03 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242213  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4281  hypothetical protein  30 
 
 
295 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3650  hypothetical protein  26.13 
 
 
286 aa  41.6  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>