20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0480 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0480  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0479  hypothetical protein  74.76 
 
 
206 aa  308  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.627606  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0478  hypothetical protein  64.34 
 
 
163 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.695853  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3422  hypothetical protein  40.21 
 
 
150 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2084  hypothetical protein  39.44 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26690  hypothetical protein  34.11 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1061  hypothetical protein  30 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3015  hypothetical protein  33.94 
 
 
179 aa  61.6  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.430528  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3650  hypothetical protein  25.71 
 
 
286 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3649  hypothetical protein  27.12 
 
 
289 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  29.57 
 
 
484 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0183  hypothetical protein  29.91 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3739  hypothetical protein  27.42 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0552  hypothetical protein  27.19 
 
 
205 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.798791  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0722  hypothetical protein  27.93 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0574  hypothetical protein  27.19 
 
 
205 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  decreased coverage  0.00309867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0562  hypothetical protein  27.19 
 
 
205 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242213  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1717  hypothetical protein  29.23 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0154176  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35360  hypothetical protein  29.36 
 
 
288 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4716  hypothetical protein  29.81 
 
 
296 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>