21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0479 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0479  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.627606  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0480  hypothetical protein  74.76 
 
 
198 aa  308  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0478  hypothetical protein  72.09 
 
 
163 aa  205  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.695853  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3422  hypothetical protein  48.82 
 
 
150 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2084  hypothetical protein  38.46 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26690  hypothetical protein  31.33 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3650  hypothetical protein  27.07 
 
 
286 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3015  hypothetical protein  29.45 
 
 
179 aa  55.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.430528  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  31.62 
 
 
484 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0562  hypothetical protein  30.84 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242213  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0552  hypothetical protein  30.84 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.798791  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0574  hypothetical protein  30.84 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  decreased coverage  0.00309867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1061  hypothetical protein  24.43 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4716  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3739  hypothetical protein  26.77 
 
 
253 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3649  hypothetical protein  26.83 
 
 
289 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35360  hypothetical protein  27.97 
 
 
288 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4281  hypothetical protein  27.88 
 
 
295 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0183  hypothetical protein  28.97 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1871  hypothetical protein  25.45 
 
 
292 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.530758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3478  hypothetical protein  25 
 
 
241 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>