13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4281 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4281  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  573  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4716  hypothetical protein  78.26 
 
 		 296 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1864  hypothetical protein  43.39 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1871  hypothetical protein  41.36 
 
 		 292 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.530758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39030  hypothetical protein  28.43 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0562  hypothetical protein  35.16 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0574  hypothetical protein  35.16 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  decreased coverage  0.00309867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0552  hypothetical protein  35.16 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.798791  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3422  hypothetical protein  31.58 
 
 		 150 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6995  hypothetical protein  28.68 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.641964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1061  hypothetical protein  30 
 
 		 174 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0479  hypothetical protein  27.88 
 
 		 206 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.627606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0478  hypothetical protein  27.19 
 
 		 163 aa  42.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.695853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>