20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0478 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.695853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0479  hypothetical protein  72.09 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.627606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0480  hypothetical protein  64.34 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3422  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2084  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26690  hypothetical protein  32.47 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3650  hypothetical protein  26.45 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3015  hypothetical protein  31.91 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.430528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1061  hypothetical protein  26.5 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0552  hypothetical protein  29.2 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.798791  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0574  hypothetical protein  29.2 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  decreased coverage  0.00309867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0562  hypothetical protein  29.2 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  26.13 
 
 		 484 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0722  hypothetical protein  28.23 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0183  hypothetical protein  31.15 
 
 		 243 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4716  hypothetical protein  29.82 
 
 		 296 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35360  hypothetical protein  29.41 
 
 		 288 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3649  hypothetical protein  26.6 
 
 		 289 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0547  hypothetical protein  27.48 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4281  hypothetical protein  27.19 
 
 		 295 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>