13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4716 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4716  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4281  hypothetical protein  78.04 
 
 		 295 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1864  hypothetical protein  39.73 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1871  hypothetical protein  39.26 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.530758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39030  hypothetical protein  29.41 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3422  hypothetical protein  33.68 
 
 		 150 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0478  hypothetical protein  29.82 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.695853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.627606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0562  hypothetical protein  33.87 
 
 		 205 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242213  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0574  hypothetical protein  33.87 
 
 		 205 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  decreased coverage  0.00309867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0552  hypothetical protein  33.87 
 
 		 205 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.798791  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2084  hypothetical protein  32.35 
 
 		 189 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0480  hypothetical protein  29.81 
 
 		 198 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>