15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39030  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6995  hypothetical protein  35.91 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.641964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1922  hypothetical protein  28.44 
 
 		 266 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0523127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1871  hypothetical protein  29.91 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.530758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4281  hypothetical protein  28.43 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4716  hypothetical protein  29.02 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0113  hypothetical protein  25.22 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1864  hypothetical protein  26.5 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5660  hypothetical protein  27.51 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19426  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01220  hypothetical protein  29 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1149  hypothetical protein  27.43 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10821  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0148  hypothetical protein  24.8 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1921  hypothetical protein  28.37 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13869  hypothetical protein  27.84 
 
 		 449 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0218064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2457  hypothetical protein  25.29 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>