14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01220 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01220  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  761    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0113  hypothetical protein  41.16 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0148  hypothetical protein  31.58 
 
 		 362 aa  145  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0178  hypothetical protein  32.69 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5660  hypothetical protein  36.44 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19426  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5030  hypothetical protein  34.19 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5118  hypothetical protein  34.19 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5411  hypothetical protein  34.19 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13869  hypothetical protein  33.74 
 
 		 449 aa  132  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0218064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1149  hypothetical protein  33.9 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10821  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5873  hypothetical protein  28.21 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0436897  normal  0.694772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39030  hypothetical protein  28.35 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1094  hypothetical protein  28.71 
 
 		 295 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1871  hypothetical protein  30.21 
 
 		 292 aa  43.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.530758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>