17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6995 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6995  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.641964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39030  hypothetical protein  35.35 
 
 
293 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1922  hypothetical protein  30.14 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0523127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1871  hypothetical protein  28.72 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.530758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4281  hypothetical protein  30.03 
 
 
295 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0148  hypothetical protein  27.31 
 
 
362 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1864  hypothetical protein  25.69 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.596563  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1149  hypothetical protein  25.82 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10821  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1921  hypothetical protein  30.06 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0574  hypothetical protein  37.07 
 
 
205 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  decreased coverage  0.00309867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0552  hypothetical protein  37.07 
 
 
205 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.798791  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0562  hypothetical protein  37.07 
 
 
205 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.242213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5660  hypothetical protein  25.27 
 
 
460 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19426  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5411  hypothetical protein  23.66 
 
 
462 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5118  hypothetical protein  23.66 
 
 
465 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80801  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5030  hypothetical protein  23.66 
 
 
465 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1094  hypothetical protein  36.47 
 
 
295 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>