21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0370 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0370  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.15539e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1886  hypothetical protein  42.55 
 
 		 153 aa  95.9  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0363859  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1887  hypothetical protein  50.63 
 
 		 262 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0692687  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3697  Interferon-induced transmembrane protein  68.97 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.240566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3696  Interferon-induced transmembrane protein  65.38 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0294  interferon-induced transmembrane protein  56 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6424  Interferon-induced transmembrane protein  44.16 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6517  interferon-induced transmembrane protein  57.14 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118232  normal  0.093626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3178  Interferon-induced transmembrane protein  38.1 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0295  heat shock protein DnaJ-like  39.39 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2010  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  52.27 
 
 		 247 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  49.02 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4718  hypothetical protein  82.14 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0066  hypothetical protein  37.7 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000164639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  68 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1652  TM2 domain-containing protein  49.09 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503869  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0211  hypothetical protein  51.61 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3176  Interferon-induced transmembrane protein  32.93 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1162  hypothetical protein  36.56 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590465  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0699  hypothetical protein  48.39 
 
 		 171 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.385809  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>