50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0289 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  240  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  69.72 
 
 
116 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  47.12 
 
 
247 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  47.12 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  42.27 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  42.42 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  47.42 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  34.23 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  45.9 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  33.65 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  40.85 
 
 
265 aa  67  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  54.69 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  34.07 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  41.18 
 
 
252 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  41.18 
 
 
252 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  54.55 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  44.12 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  54 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  37.5 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  52 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  52 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  44.12 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  36.67 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  37.84 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  50 
 
 
71 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  50 
 
 
71 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  28.57 
 
 
364 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1652  TM2 domain-containing protein  38.46 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503869  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  37.8 
 
 
336 aa  52  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  32.5 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4395  hypothetical protein  38.81 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0941957 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0616  hypothetical protein  33.73 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.460301  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4736  hypothetical protein  37.1 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0156129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0601  hypothetical protein  33.75 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0624  hypothetical protein  54.29 
 
 
71 aa  47  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.317815  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  51.22 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  35.53 
 
 
305 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  33.33 
 
 
212 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0370  hypothetical protein  68 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.15539e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  34.85 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  37.84 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3451  hypothetical protein  32.88 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal  0.149126 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  38.98 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  32.43 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  35.71 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  28.95 
 
 
265 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2971  hypothetical protein  34.67 
 
 
177 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0405  hypothetical protein  34.67 
 
 
177 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>