34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0660 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  259  6e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  53.33 
 
 		 92 aa  84.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  53.33 
 
 		 92 aa  84.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  60.32 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  57.97 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  50 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  59.65 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  58.62 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  62.75 
 
 		 247 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  56.72 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  56.72 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  75.93 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0612  hypothetical protein  56.6 
 
 		 53 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  46.94 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  46.94 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0624  hypothetical protein  49.23 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.317815  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  38.67 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  57.89 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  39.6 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  46.67 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  46.67 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  35.06 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  45.24 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  42.86 
 
 		 265 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  50 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  48.21 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  45.45 
 
 		 336 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  38.36 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0041  hypothetical protein  40.98 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  44 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  36.99 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  41.79 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  42.31 
 
 		 344 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>