24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17940 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  100 
 
 		 344 aa  684    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  47.95 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  44.44 
 
 		 194 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  47.83 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0258  hypothetical protein  51.79 
 
 		 110 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000028904  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1399  TM2 domain containing protein  45.31 
 
 		 113 aa  63.9  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  46.03 
 
 		 176 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4067  TM2 domain containing protein  36.19 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2756  TM2 domain containing protein  45.76 
 
 		 67 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000265887  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2238  TM2 domain-containing protein  47.46 
 
 		 101 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2746  TM2 domain containing protein  45.76 
 
 		 67 aa  57.4  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000224877  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  43.28 
 
 		 131 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  41.18 
 
 		 161 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  42.03 
 
 		 107 aa  53.1  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  42.62 
 
 		 107 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 137 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  43.1 
 
 		 107 aa  49.3  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  34.65 
 
 		 159 aa  48.5  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  42.86 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  33.85 
 
 		 113 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0041  hypothetical protein  46.81 
 
 		 80 aa  46.6  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1354  hypothetical protein  24.03 
 
 		 125 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.402691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  33.85 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>