39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0604 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  68.32 
 
 		 109 aa  148  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  52.45 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  47.62 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  46.59 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  44.94 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  40 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  44.94 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  39.5 
 
 		 336 aa  71.6  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  30 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  31.78 
 
 		 148 aa  62  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  29.8 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  44.62 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  41.18 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  51.92 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  34.48 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  43.24 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  43.75 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  40 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  36.25 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  40.98 
 
 		 137 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  49.09 
 
 		 87 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  30.37 
 
 		 146 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  50.88 
 
 		 117 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  42.65 
 
 		 92 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 79 aa  48.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  43.55 
 
 		 154 aa  47.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  30.71 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  38.1 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  32.73 
 
 		 92 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  45.28 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  39.19 
 
 		 100 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  43.4 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  33.85 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  38.1 
 
 		 99 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 116 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  52.63 
 
 		 364 aa  42  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  41.79 
 
 		 128 aa  41.2  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>