57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2995 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 116 aa  233  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  69.72 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  53.92 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  44.44 
 
 		 247 aa  98.6  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  41.51 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  42.7 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  50.77 
 
 		 252 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  50.77 
 
 		 252 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  58.62 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  59.38 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  49.21 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  40 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  47.83 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  51.72 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  51.72 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  52.63 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  39.13 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  44.59 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  39.36 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  38.95 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  49.09 
 
 		 100 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  29.41 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  44.83 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  44.83 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  34.95 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  39.74 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1652  TM2 domain-containing protein  37.84 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  35.53 
 
 		 336 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  33.82 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0370  hypothetical protein  49.02 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.15539e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  39.68 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  39.68 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0624  hypothetical protein  53.66 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.317815  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  30.33 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  38.16 
 
 		 305 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0616  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.460301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2261  TM2 domain-containing protein  46.3 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46379  normal  0.197019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  34.62 
 
 		 265 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0612  hypothetical protein  41.67 
 
 		 53 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  34.57 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4395  hypothetical protein  48.89 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0941957 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  32.5 
 
 		 190 aa  42.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  39.29 
 
 		 137 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  50 
 
 		 160 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  36.92 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4736  hypothetical protein  35.62 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0156129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  41.94 
 
 		 253 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  40.62 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  34.41 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3451  hypothetical protein  33.8 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal  0.149126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  40.82 
 
 		 133 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  43.75 
 
 		 117 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>