58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0230 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 107 aa  214  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  86.92 
 
 		 107 aa  189  7e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  84.11 
 
 		 107 aa  185  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  46.15 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  59.46 
 
 		 253 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  37.6 
 
 		 212 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  44.94 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  55.71 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  41.35 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  44.3 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  36.79 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  50 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  45.12 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  40.86 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  39.36 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  46.38 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  38.95 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  47.42 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  41.3 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  46.67 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  50 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  52.38 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  45.71 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  35.79 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  40.48 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  39.78 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  41.54 
 
 		 265 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  37.68 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  36.07 
 
 		 364 aa  50.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  43.1 
 
 		 344 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  35.96 
 
 		 247 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  43.86 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  36.84 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  41.25 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  40.58 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0415  hypothetical protein  57.14 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  37.84 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1399  TM2 domain containing protein  27.52 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  36.49 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1652  TM2 domain-containing protein  30.26 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503869  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  45.07 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  47.73 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  47.5 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0419  hypothetical protein  36.54 
 
 		 239 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.613009  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  36.73 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0114  hypothetical protein  39.13 
 
 		 266 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000247696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2238  TM2 domain-containing protein  42.19 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0116  hypothetical protein  36.96 
 
 		 266 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0512  hypothetical protein  44.83 
 
 		 289 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5035  hypothetical protein  28.77 
 
 		 459 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2044  hypothetical protein  35.9 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000114034  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  34.33 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>