21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0929 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  253  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  84.68 
 
 
125 aa  219  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4395  hypothetical protein  56.59 
 
 
132 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0941957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0601  hypothetical protein  54.55 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0616  hypothetical protein  54.55 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.460301  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4736  hypothetical protein  51.54 
 
 
128 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0156129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  35.29 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  35.29 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  46.94 
 
 
118 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  41.79 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  39.68 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  46.51 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  45.24 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  31.94 
 
 
265 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  50 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  28.89 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  33.85 
 
 
247 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  41.67 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  37.21 
 
 
71 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0646  hypothetical protein  36.36 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  32.14 
 
 
97 aa  40  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>