51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1421 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  60.94 
 
 		 99 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  59.38 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  75.93 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  39.13 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  38.61 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  58.82 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  53.33 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  46.48 
 
 		 336 aa  67  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  57.69 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  40.26 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  38.16 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  42.11 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  40.3 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  40.3 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  28.16 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  36.13 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  47.14 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  54 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  54 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  42.47 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  48.28 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  43.06 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  30.25 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  41.89 
 
 		 265 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  45 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  31.11 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  39.73 
 
 		 305 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  45.45 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  45.45 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  36.07 
 
 		 265 aa  50.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  45.45 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  42.86 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  47.54 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  27.56 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0612  hypothetical protein  53.66 
 
 		 53 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  42.11 
 
 		 253 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  55.26 
 
 		 344 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0624  hypothetical protein  52.5 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.317815  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  38.57 
 
 		 194 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  36.51 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  24.37 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  48 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3198  TM2 domain-containing protein  26.76 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.827821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  28.12 
 
 		 364 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4395  hypothetical protein  43.48 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0941957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>