23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3393 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 113 aa  238  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  72.22 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  72.34 
 
 		 97 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  37 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  41.79 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  41.79 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  33.65 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  33 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  41.82 
 
 		 265 aa  51.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  42.11 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  36.54 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  36.54 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  38.46 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  38.18 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  46.67 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  40 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  39.29 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0624  hypothetical protein  47.5 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.317815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4395  hypothetical protein  41.38 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0941957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>