23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4098 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  261  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  72.22 
 
 		 113 aa  179  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  72.16 
 
 		 97 aa  158  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  41.51 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  39.22 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  34.23 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  32.11 
 
 		 247 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  38.46 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  38.46 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  48.21 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  40 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  40.26 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  46.67 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  36.54 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  40 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0624  hypothetical protein  47.5 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.317815  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  28.87 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  25.23 
 
 		 364 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4395  hypothetical protein  41.38 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0941957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>