22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3752 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 97 aa  204  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  72.16 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  72.34 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  42.7 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  39.53 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  39.08 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  34.07 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  38.57 
 
 		 252 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  38.57 
 
 		 252 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  38.16 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  48.08 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  42.86 
 
 		 265 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  45.24 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  36.54 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  36.54 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  36.92 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4395  hypothetical protein  38.81 
 
 		 132 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0941957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  45.95 
 
 		 161 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  32.69 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  32.14 
 
 		 124 aa  40  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  36.73 
 
 		 71 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  36.73 
 
 		 71 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>