48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0822 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  100 
 
 
161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  46.38 
 
 
107 aa  61.6  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  46.38 
 
 
107 aa  61.6  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  47.95 
 
 
107 aa  61.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  40.43 
 
 
131 aa  60.8  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  30.95 
 
 
252 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  30.95 
 
 
252 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4736  hypothetical protein  32.35 
 
 
128 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0156129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  42.31 
 
 
194 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  46.58 
 
 
212 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  37.97 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  40 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  34.48 
 
 
190 aa  55.5  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  35.29 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  41.18 
 
 
344 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  45.21 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  45 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  44.12 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  38.67 
 
 
128 aa  52  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  45.07 
 
 
133 aa  51.2  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  40.62 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  37.62 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1399  TM2 domain containing protein  34.85 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452664  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  29.85 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  35.29 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  34.09 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  40 
 
 
253 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2756  TM2 domain containing protein  40.62 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000265887  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  52.63 
 
 
336 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0601  hypothetical protein  27.41 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  38.1 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  38.16 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0616  hypothetical protein  27.41 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.460301  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0041  hypothetical protein  54.76 
 
 
80 aa  44.7  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  34.18 
 
 
127 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  34.18 
 
 
127 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  34.18 
 
 
127 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  38.1 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  28.89 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  32.18 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0737  hypothetical protein  65.52 
 
 
118 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849645  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  45.95 
 
 
97 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0258  hypothetical protein  33.85 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000028904  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  48.48 
 
 
210 aa  41.6  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2746  TM2 domain containing protein  38.81 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000224877  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  33.7 
 
 
200 aa  40.8  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  40.62 
 
 
116 aa  40.8  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  37.18 
 
 
155 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>