59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2773 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  55.79 
 
 		 99 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 116 aa  98.6  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  46.23 
 
 		 118 aa  90.9  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  62.75 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  32.47 
 
 		 364 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  47.46 
 
 		 71 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  47.46 
 
 		 71 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  56 
 
 		 70 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  50 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  47.46 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  47.46 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  39.08 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  47.27 
 
 		 67 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  33 
 
 		 113 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  51.79 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  42.86 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  36.46 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  55.81 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  43.1 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  43.1 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1656  pilin domain-containing protein  66.67 
 
 		 74 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000269442  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1652  TM2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 108 aa  53.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1636  pilin domain-containing protein  61.36 
 
 		 74 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1399  N-terminal methylation  61.54 
 
 		 69 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0370  hypothetical protein  52.27 
 
 		 124 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.15539e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0624  hypothetical protein  44.07 
 
 		 71 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.317815  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  41.67 
 
 		 148 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2590  pilin domain protein  66.67 
 
 		 76 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1496  pilin domain-containing protein  61.54 
 
 		 90 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232938  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 107 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 107 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  31.13 
 
 		 107 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0612  hypothetical protein  48.94 
 
 		 53 aa  46.2  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  37.5 
 
 		 135 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3451  hypothetical protein  34.09 
 
 		 106 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal  0.149126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  32.88 
 
 		 148 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.35 
 
 		 157 aa  45.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  42.11 
 
 		 138 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  40 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  28.46 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  39.34 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  40.38 
 
 		 168 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  36.51 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  41.54 
 
 		 129 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  44 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  35.48 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  38.81 
 
 		 133 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  33.85 
 
 		 124 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 125 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  32.88 
 
 		 336 aa  42.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 149 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 		 145 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 		 145 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  31.34 
 
 		 145 aa  42.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 150 aa  42  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.82 
 
 		 167 aa  42  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 143 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>