33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0888 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  48.39 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  50 
 
 		 336 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  51.22 
 
 		 305 aa  81.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  45.45 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  35.46 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  48.35 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  48.28 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  42.68 
 
 		 265 aa  67  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  37.78 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  40.91 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  42.67 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  42.86 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  35 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  49.02 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  47.06 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  45 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  37.84 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  38.71 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  43.06 
 
 		 252 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  43.06 
 
 		 252 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  43.55 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  46.48 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  45.07 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  44.62 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  38.24 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  35.21 
 
 		 109 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  28.71 
 
 		 137 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1004  hypothetical protein  28.95 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>