36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0975 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  50.77 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  35.29 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  35.29 
 
 
125 aa  70.5  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4395  hypothetical protein  35.25 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0941957 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  32.06 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  50 
 
 
99 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3393  TM2 domain-containing protein  41.79 
 
 
113 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0930  hypothetical protein  32 
 
 
177 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4098  TM2 domain-containing protein  38.46 
 
 
124 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  30.95 
 
 
161 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  46.94 
 
 
128 aa  59.3  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  41.51 
 
 
71 aa  59.3  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  43.28 
 
 
92 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  43.28 
 
 
92 aa  58.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3752  TM2 domain-containing protein  38.57 
 
 
97 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  43.64 
 
 
118 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4560  hypothetical protein  30.4 
 
 
167 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4736  hypothetical protein  31.15 
 
 
128 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0156129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  43.1 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0780  hypothetical protein  39.29 
 
 
67 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0601  hypothetical protein  28 
 
 
135 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0616  hypothetical protein  28 
 
 
135 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.460301  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1225  hypothetical protein  26.36 
 
 
176 aa  48.9  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  43.06 
 
 
154 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  31.15 
 
 
100 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1421  TM2 domain containing protein  40.3 
 
 
149 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0216087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4394  hypothetical protein  27.2 
 
 
193 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102904 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1121  TM2 domain-containing protein  44.68 
 
 
71 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1098  TM2 domain-containing protein  44.68 
 
 
71 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000223693  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0482  hypothetical protein  46.51 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0624  hypothetical protein  47.73 
 
 
71 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.317815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  40.74 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0496  DNA uptake-like protein  28.29 
 
 
220 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194671  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0869  hypothetical protein  19.51 
 
 
196 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000493602  normal  0.0426802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>