48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0591 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  100 
 
 		 133 aa  269  9e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  46.15 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  42.11 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  55.26 
 
 		 212 aa  83.6  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  40 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  49.37 
 
 		 253 aa  73.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  50 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  48 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  42.17 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  42.42 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  45.95 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  46.97 
 
 		 305 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  45.45 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  37.76 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  42.86 
 
 		 364 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  41.33 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  40.26 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  45.9 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  45.07 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  42.62 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  29.23 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  54.32 
 
 		 210 aa  50.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  40.54 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  41.89 
 
 		 194 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  37.8 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  40.98 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  42.31 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  35 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  35 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  35 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  39.68 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3401  hypothetical protein  36.54 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000214413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  39.51 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0010  hypothetical protein  40.82 
 
 		 1503 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.969118  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.46 
 
 		 1141 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1652  TM2 domain-containing protein  27.37 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503869  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  36.54 
 
 		 388 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  40.85 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  38.81 
 
 		 247 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1521  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 		 295 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111872  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  43.18 
 
 		 344 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4216  FHA domain-containing protein  38.89 
 
 		 287 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000473857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  45 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>