30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3062 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  100 
 
 
127 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  100 
 
 
127 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  100 
 
 
127 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  67.23 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  63.78 
 
 
146 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  78.26 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  58.24 
 
 
176 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  57.78 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  50.5 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  45.13 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  54.88 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  42.75 
 
 
146 aa  76.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  42.15 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  45.88 
 
 
107 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  46.99 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  49.32 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  33.6 
 
 
212 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  30.97 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  36.67 
 
 
253 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  27.86 
 
 
190 aa  53.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  43.84 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  36.71 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  31.43 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  42.47 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  42.86 
 
 
344 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  42.62 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0258  hypothetical protein  49.09 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000028904  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1399  TM2 domain containing protein  50 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452664  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  32.26 
 
 
210 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  33.33 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>