26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27311 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  60.24 
 
 
336 aa  98.6  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  51.09 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  55.42 
 
 
159 aa  90.9  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  51.81 
 
 
305 aa  87  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  50 
 
 
265 aa  81.3  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  51.14 
 
 
92 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  41.3 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  57.47 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  43.37 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  48.91 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  50 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  39.09 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  42.47 
 
 
212 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  44.83 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  36.47 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  42.65 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  42.65 
 
 
190 aa  48.9  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  41.18 
 
 
253 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  40 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  43.24 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  42.19 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  42.19 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  39.68 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  40.28 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  29.73 
 
 
99 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>