39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0836 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  100 
 
 
79 aa  151  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  73.68 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  60 
 
 
336 aa  98.6  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  50 
 
 
305 aa  80.9  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  52.87 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  40.4 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  60.71 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  62.65 
 
 
87 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  43.18 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  51.9 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  45.98 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  44.58 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  42.86 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  49.43 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  36.36 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  59.32 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  41.67 
 
 
253 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  50.85 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  47.54 
 
 
212 aa  57  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  47.62 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  51.56 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  43.94 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  50.91 
 
 
190 aa  54.7  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  49.18 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  41.18 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  43.94 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  39.44 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  42.62 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  46.38 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  45.31 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  40 
 
 
247 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1224  TM2 domain-containing protein  32.43 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  34.33 
 
 
176 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0929  hypothetical protein  30.26 
 
 
124 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  38.98 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  38.98 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0828  TM2 domain containing protein  28.12 
 
 
265 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0289  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0163105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  53.85 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>