78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5432 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  43.59 
 
 		 166 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  60 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  62.5 
 
 		 131 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  54.84 
 
 		 155 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  56.16 
 
 		 137 aa  84  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  37.34 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  42.55 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  44.44 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  38.66 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  43.28 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  44.59 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  45.76 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  51.14 
 
 		 146 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  48.57 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  40.3 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  39.74 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  51.79 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  42.31 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  45.21 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  33.33 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  48.08 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  47.14 
 
 		 107 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  45.71 
 
 		 107 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  45.71 
 
 		 107 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1399  TM2 domain containing protein  37.5 
 
 		 113 aa  52  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452664  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 127 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 127 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 127 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2756  TM2 domain containing protein  39.71 
 
 		 67 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000265887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  37.93 
 
 		 253 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  39.47 
 
 		 168 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  41.89 
 
 		 133 aa  48.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  38.46 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  39.73 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  34.57 
 
 		 109 aa  47.4  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  41.67 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0604  hypothetical protein  41.67 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  37.21 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2746  TM2 domain containing protein  36.76 
 
 		 67 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000224877  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  41.67 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0258  hypothetical protein  42 
 
 		 110 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000028904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  43.08 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  34.15 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  34.12 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  42.11 
 
 		 113 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  38.33 
 
 		 154 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  35.71 
 
 		 156 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  42.59 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0159  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  40 
 
 		 179 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  37.1 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  36.11 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  41.38 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10047  hypothetical protein  36.51 
 
 		 289 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  28.32 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2238  TM2 domain-containing protein  38.6 
 
 		 101 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  35.48 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  38.33 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  38.18 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  35.09 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  40.68 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  35.8 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  34.29 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  40.62 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  40.62 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  40.62 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  35.85 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  32.93 
 
 		 175 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  33.9 
 
 		 146 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  37.68 
 
 		 148 aa  42  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  32.93 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  36.21 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  43.33 
 
 		 92 aa  41.6  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  39.66 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  38.18 
 
 		 234 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  42.31 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>