29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01500 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  100 
 
 
265 aa  533  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  63.95 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  56.57 
 
 
159 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  45.76 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  46.85 
 
 
212 aa  86.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  42.31 
 
 
148 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  30.53 
 
 
201 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  43.9 
 
 
91 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  37.65 
 
 
91 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  42.68 
 
 
154 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  41.38 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  34.04 
 
 
190 aa  63.2  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  48.1 
 
 
88 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  39.74 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  39.08 
 
 
181 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  42.42 
 
 
133 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  46.84 
 
 
87 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  34.48 
 
 
131 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  36.59 
 
 
107 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  38.67 
 
 
107 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  43.08 
 
 
107 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  41.67 
 
 
79 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  40 
 
 
137 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  39.13 
 
 
109 aa  50.4  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  31.96 
 
 
116 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  34.4 
 
 
160 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  36.36 
 
 
99 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  37.14 
 
 
71 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>