44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1913 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  76.64 
 
 		 137 aa  165  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  62.5 
 
 		 194 aa  90.5  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  55.17 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  52.63 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  46.81 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  55.71 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  54.17 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  43.62 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  45.16 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  48.31 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  44.32 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  51.47 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  51.22 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  51.22 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  51.22 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  48 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  40.43 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  54.67 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  56.86 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  40.48 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  40 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  43.28 
 
 		 344 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  37.04 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  40.54 
 
 		 265 aa  52.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  40 
 
 		 336 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  36.63 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  41.18 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  37.18 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  40.58 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  39.19 
 
 		 305 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  35.9 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2756  TM2 domain containing protein  42.47 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000265887  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  53.66 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  40.43 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  36.99 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2746  TM2 domain containing protein  38.36 
 
 		 67 aa  43.5  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000224877  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  38.71 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  47.92 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  34.85 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  29.37 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  44.64 
 
 		 71 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  40.62 
 
 		 117 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>