30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2984 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  100 
 
 		 305 aa  597  1e-169  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  63.95 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  63.53 
 
 		 159 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  61.18 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  53.93 
 
 		 148 aa  96.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  54.43 
 
 		 92 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  42.17 
 
 		 91 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  47.06 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  51.22 
 
 		 154 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  39.08 
 
 		 91 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  38.98 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  55.95 
 
 		 87 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  48.1 
 
 		 92 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  48.81 
 
 		 88 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  52.27 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  42.86 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  44.93 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  32.17 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  46.97 
 
 		 107 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  40.3 
 
 		 109 aa  55.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  40.24 
 
 		 131 aa  52.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  31.36 
 
 		 116 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  34.94 
 
 		 137 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  36.84 
 
 		 99 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  33.57 
 
 		 146 aa  45.8  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 176 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>