34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2315 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  285  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  43.71 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  44.95 
 
 		 161 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  45.16 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  38.78 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  38.66 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  40.2 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  39.36 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  41.3 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  39.22 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  35.48 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  42 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  42 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  42 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  29.23 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  30.37 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  36.84 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  40.37 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  41.77 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  27.73 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  30.33 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  30.43 
 
 		 336 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  34.09 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  36.25 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  37.96 
 
 		 210 aa  41.6  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  34.29 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  35.06 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  32.32 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3614  Forkhead-associated protein  51.43 
 
 		 835 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158405  hitchhiker  0.00251691 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  34.15 
 
 		 305 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>