48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1837 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1837  TM2  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  48.39 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  54.65 
 
 		 305 aa  94.4  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  50.59 
 
 		 336 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  48.28 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  50 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  43.37 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  31.87 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  41.84 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  46.84 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  40.48 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  38.89 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  53.42 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  31.78 
 
 		 190 aa  62  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  44.59 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  46.84 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  44.05 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  50.63 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  45.71 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  33.66 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  41.67 
 
 		 247 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  36.84 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  39.6 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2261  TM2 domain-containing protein  40.98 
 
 		 103 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46379  normal  0.197019 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  35.21 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  40.58 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  36.36 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  49.18 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  36.21 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  38.16 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1273  TM2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1298  TM2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  36.99 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  36.99 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  28.21 
 
 		 364 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  46.15 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  40.85 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  44.23 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4736  hypothetical protein  39.73 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0156129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  40.48 
 
 		 253 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2292  hypothetical protein  31.03 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0948  TM2 domain containing protein  47.06 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0975  TM2 domain containing protein  47.06 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2649  TM2 domain containing protein  42.19 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0744  hypothetical protein  27.42 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>