39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3666 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  100 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  43.71 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  53.54 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  53.85 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  37.58 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  45.54 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  38.19 
 
 		 212 aa  63.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  36.89 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  47.37 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  47.37 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  47.37 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  40.86 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  42.17 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  29.8 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  41.98 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  37.35 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  40.48 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  41.98 
 
 		 107 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1700  TM2 domain-containing protein  38.81 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0217305  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  42.57 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  32.89 
 
 		 305 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  34.09 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  37.62 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2084  TM2 domain containing protein  48.48 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2261  TM2 domain-containing protein  35.11 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46379  normal  0.197019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  32.88 
 
 		 336 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  44.93 
 
 		 117 aa  48.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  47.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  36.36 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  32.95 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  35.87 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  41.43 
 
 		 111 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  29.63 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  42.31 
 
 		 265 aa  44.7  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  30.34 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 253 aa  42.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 116 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  35.44 
 
 		 344 aa  40.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>