27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11631 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  286  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  66.67 
 
 
161 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  74.42 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  74.42 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  74.42 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  75 
 
 
143 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  56.04 
 
 
176 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  58.89 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  43.61 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  52.27 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  46.09 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  54.79 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  38.56 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  49.32 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  45.35 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  49.32 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  35.43 
 
 
212 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  30.71 
 
 
190 aa  55.1  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  39.29 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  46.58 
 
 
133 aa  50.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  45.45 
 
 
210 aa  50.1  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  35.78 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  43.42 
 
 
253 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  30.36 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  41.03 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  38.67 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  42.62 
 
 
92 aa  40.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>