33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1541 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  100 
 
 		 133 aa  269  9e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1399  TM2 domain containing protein  56.67 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452664  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  47.95 
 
 		 344 aa  70.5  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0258  hypothetical protein  54.55 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000028904  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  46.75 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  44.59 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2756  TM2 domain containing protein  43.08 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000265887  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2746  TM2 domain containing protein  41.54 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000224877  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  41.79 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  44.3 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  36.63 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  40.62 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  53.85 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0041  hypothetical protein  58.7 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  49.06 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  49.06 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  49.06 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  48.21 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  44.64 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  51.02 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 253 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  44.64 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4067  TM2 domain containing protein  46.67 
 
 		 469 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  30.34 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  38.67 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3023  hypothetical protein  36.84 
 
 		 88 aa  42  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2238  TM2 domain-containing protein  46.94 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  34.29 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  44.44 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  40.82 
 
 		 116 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>