86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25400 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  100 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  42.56 
 
 		 194 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  59.46 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  52.63 
 
 		 131 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  55.71 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  55.74 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  60 
 
 		 152 aa  72  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  51.47 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  33.55 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  52.63 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  43.28 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  39.36 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  31.53 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  43.55 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  31 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  34.57 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  37.5 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  43.75 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  42.11 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  41.3 
 
 		 253 aa  52.4  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  48.15 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  33.09 
 
 		 206 aa  51.2  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 107 aa  51.2  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  40.98 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  43.1 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  45.45 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  40.35 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  37.68 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  43.55 
 
 		 248 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  42.86 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  32.24 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  37.68 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  41.51 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  45.45 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  35.19 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  40.32 
 
 		 206 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  41.25 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  38.89 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  44.44 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  39.06 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  29.86 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  43.1 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  40.35 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  37.5 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  29.91 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  31.94 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  37.33 
 
 		 209 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  38.03 
 
 		 229 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  36.36 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  39.71 
 
 		 227 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  41.27 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  46.3 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  29.63 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  36.71 
 
 		 212 aa  44.7  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  31.08 
 
 		 200 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  37.33 
 
 		 191 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  46 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  28.83 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  35.59 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0043  protein of unknown function DUF1707  52.63 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  34.78 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  37.74 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  35.82 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  38.98 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  37.35 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  30.77 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  37.29 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  34.78 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  41.33 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  38.6 
 
 		 142 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  48.15 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  36.51 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  38.18 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  44.07 
 
 		 215 aa  41.2  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4063  protein of unknown function DUF1707  47.73 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  38.46 
 
 		 197 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0604  hypothetical protein  33.93 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  38.46 
 
 		 197 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  33.93 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  38.03 
 
 		 206 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  32.43 
 
 		 200 aa  40.8  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  33.93 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  29.73 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>