29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2820 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  272  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  65.84 
 
 		 161 aa  153  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  74.47 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  79.07 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  79.07 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  79.07 
 
 		 127 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  53.85 
 
 		 176 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  60 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  38.61 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  58.9 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  56.76 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  37.42 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  38.81 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  42.22 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  44.19 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  35.83 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  46.67 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  44.74 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  45.21 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  36.71 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  43.84 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  47.54 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1821 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  34.15 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  43.48 
 
 		 336 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  42.62 
 
 		 344 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  35.29 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  36.84 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  45.65 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>