31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23650 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  100 
 
 		 336 aa  635    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  61.18 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  63.53 
 
 		 159 aa  116  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  56.1 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  60.24 
 
 		 92 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  48.39 
 
 		 148 aa  93.6  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  58.75 
 
 		 92 aa  92.8  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  44.58 
 
 		 91 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  65.48 
 
 		 87 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 154 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  46.25 
 
 		 91 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  41.25 
 
 		 190 aa  86.3  7e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  48.75 
 
 		 212 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  56.18 
 
 		 88 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  48.51 
 
 		 201 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  56.32 
 
 		 79 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  45.65 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  32.75 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  41.05 
 
 		 107 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  38.2 
 
 		 109 aa  65.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  48.48 
 
 		 107 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  39.53 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  35.53 
 
 		 116 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  36.99 
 
 		 160 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  29.1 
 
 		 1646 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  29.8 
 
 		 146 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  33.78 
 
 		 99 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0065  hypothetical protein  48.19 
 
 		 1024 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>