36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4699 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  91.82 
 
 		 111 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  51.19 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2261  TM2 domain-containing protein  42.27 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46379  normal  0.197019 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1604  TM2 domain containing protein  39.74 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.345673 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1932  TM2 domain containing protein  39.74 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.533409  normal  0.0149218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1614  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  49.02 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1809  TM2  33.33 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257578  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1715  TM2  41.67 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.67624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  45.9 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0744  TM2  34.57 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1791  TM2  42.65 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0956269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  37.18 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2084  TM2 domain containing protein  39.39 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  40.24 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  49.09 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  45.76 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  35.9 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  43.55 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  35.87 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  36.49 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  45.28 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  44.64 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  53.19 
 
 		 364 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  44.23 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  45 
 
 		 113 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 253 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  39.13 
 
 		 265 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  37.7 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0660  hypothetical protein  36.99 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  37.7 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  36.92 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  40 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2773  hypothetical protein  45.1 
 
 		 247 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.00177e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>