33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03530 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  100 
 
 		 159 aa  332  1e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  63.53 
 
 		 305 aa  121  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  62.2 
 
 		 265 aa  114  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  63.53 
 
 		 336 aa  113  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  55.42 
 
 		 92 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  48.28 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  35.46 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  42.71 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  44.3 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  36.92 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  40.51 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  50.63 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  41.18 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  46.67 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  40 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  48.31 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  43.94 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  45.33 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  44.12 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  51.9 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  40.54 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  40.58 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  34.65 
 
 		 344 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  32.95 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2995  TM2 domain-containing protein  34.57 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  33.72 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1659  hypothetical protein  32.35 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  30.7 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4736  hypothetical protein  36.11 
 
 		 128 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0156129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2495  TM2 domain containing protein  32.89 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  32.32 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>