18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1547 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  78.02 
 
 
91 aa  147  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  51.09 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  44.58 
 
 
336 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  42.17 
 
 
305 aa  86.3  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  52.33 
 
 
92 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  44.3 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  42.35 
 
 
265 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  40 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  45.05 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  43.48 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  40.48 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  42.05 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  34 
 
 
201 aa  55.1  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  37.68 
 
 
253 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  34.85 
 
 
212 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  31.88 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  37.08 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>