25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1506 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  100 
 
 
87 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  65.48 
 
 
336 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  65.12 
 
 
88 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  59.76 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  60.23 
 
 
92 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  55.95 
 
 
305 aa  90.1  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  45.05 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1814  hypothetical protein  45.05 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  48.31 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  42.86 
 
 
201 aa  80.5  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  61.45 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0888  TM2 domain-containing protein  50.67 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  50.63 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  46.84 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  49.32 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  41.05 
 
 
181 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  49.25 
 
 
190 aa  60.8  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  46.38 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  47.54 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  44.64 
 
 
253 aa  53.9  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  48.33 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  40.85 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  48.33 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  46.27 
 
 
131 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  46.15 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.134509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>